Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSP4

LCN1P1, Putative lipocalin 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P1Q5VSP4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LCN1P1Q5VSP4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms