Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LDLRAP1Q5SW96 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms