Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms