Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms