Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC38Q502W7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms