Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF1Q3BBV0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms