Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NEDD8Q15843 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NEDD8Q15843 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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NEDD8Q15843 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NEDD8Q15843 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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