Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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