Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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TRAF1Q13077 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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TRAF1Q13077 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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TRAF1Q13077 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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TRAF1Q13077 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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TRAF1Q13077 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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TRAF1Q13077 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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TRAF1Q13077 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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TRAF1Q13077 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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TRAF1Q13077 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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