Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR1Q03591 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms