Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms