Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYBPC1Q00872 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYBPC1Q00872 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms