Protein–RNA interactions for Protein: P62502

LCN6, Epididymal-specific lipocalin-6, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN6P62502 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LCN6P62502 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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LCN6P62502 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LCN6P62502 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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LCN6P62502 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LCN6P62502 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCN6P62502 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LCN6P62502 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LCN6P62502 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LCN6P62502 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LCN6P62502 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LCN6P62502 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LCN6P62502 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LCN6P62502 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCN6P62502 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LCN6P62502 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCN6P62502 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LCN6P62502 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LCN6P62502 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LCN6P62502 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCN6P62502 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCN6P62502 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCN6P62502 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCN6P62502 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCN6P62502 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCN6P62502 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCN6P62502 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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