Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms