Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTKP29376 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LTKP29376 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LTKP29376 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTKP29376 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTKP29376 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTKP29376 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTKP29376 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LTKP29376 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LTKP29376 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTKP29376 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTKP29376 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTKP29376 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms