Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLD1P28340 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLD1P28340 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLD1P28340 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLD1P28340 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms