Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA3P26006 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA3P26006 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms