Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNNI3P19429 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms