Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPI1P17947 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPI1P17947 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPI1P17947 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPI1P17947 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPI1P17947 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPI1P17947 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPI1P17947 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPI1P17947 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPI1P17947 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPI1P17947 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPI1P17947 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPI1P17947 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SPI1P17947 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPI1P17947 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPI1P17947 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SPI1P17947 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPI1P17947 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPI1P17947 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPI1P17947 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SPI1P17947 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SPI1P17947 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPI1P17947 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SPI1P17947 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPI1P17947 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPI1P17947 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPI1P17947 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPI1P17947 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPI1P17947 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPI1P17947 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPI1P17947 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPI1P17947 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPI1P17947 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPI1P17947 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPI1P17947 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPI1P17947 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPI1P17947 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SPI1P17947 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPI1P17947 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPI1P17947 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPI1P17947 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPI1P17947 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPI1P17947 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPI1P17947 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPI1P17947 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPI1P17947 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPI1P17947 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPI1P17947 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPI1P17947 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPI1P17947 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPI1P17947 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPI1P17947 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPI1P17947 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPI1P17947 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms