Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHGAP10645 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHGAP10645 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHGAP10645 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHGAP10645 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHGAP10645 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHGAP10645 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHGAP10645 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHGAP10645 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHGAP10645 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHGAP10645 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHGAP10645 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHGAP10645 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHGAP10645 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHGAP10645 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHGAP10645 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHGAP10645 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHGAP10645 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHGAP10645 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHGAP10645 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHGAP10645 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHGAP10645 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHGAP10645 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHGAP10645 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHGAP10645 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHGAP10645 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHGAP10645 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHGAP10645 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHGAP10645 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHGAP10645 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHGAP10645 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHGAP10645 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHGAP10645 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHGAP10645 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHGAP10645 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHGAP10645 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHGAP10645 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHGAP10645 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHGAP10645 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHGAP10645 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHGAP10645 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHGAP10645 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHGAP10645 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHGAP10645 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHGAP10645 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHGAP10645 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHGAP10645 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHGAP10645 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHGAP10645 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHGAP10645 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHGAP10645 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHGAP10645 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHGAP10645 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHGAP10645 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHGAP10645 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHGAP10645 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHGAP10645 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHGAP10645 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHGAP10645 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHGAP10645 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHGAP10645 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHGAP10645 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHGAP10645 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHGAP10645 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms