Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA3O75145 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA3O75145 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms