Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSVO60911 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSVO60911 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms