Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX1O43812 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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