Protein–RNA interactions for Protein: O43361

ZNF749, Zinc finger protein 749, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF749O43361 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF749O43361 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms