Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms