Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms