Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHMP3Q9Y3E7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms