Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HIF3AQ9Y2N7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HIF3AQ9Y2N7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HIF3AQ9Y2N7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HIF3AQ9Y2N7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HIF3AQ9Y2N7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HIF3AQ9Y2N7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIF3AQ9Y2N7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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