Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC8Q9Y2L5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms