Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF24Q9UPV7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHF24Q9UPV7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms