Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PADI1Q9ULC6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms