Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM5BQ9UGL1 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms