Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms