Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms