Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms