Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms