Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRBNQ96SW2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRBNQ96SW2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRBNQ96SW2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRBNQ96SW2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRBNQ96SW2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRBNQ96SW2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CRBNQ96SW2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRBNQ96SW2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRBNQ96SW2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRBNQ96SW2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRBNQ96SW2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRBNQ96SW2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRBNQ96SW2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRBNQ96SW2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRBNQ96SW2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRBNQ96SW2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRBNQ96SW2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRBNQ96SW2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRBNQ96SW2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRBNQ96SW2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms