Protein–RNA interactions for Protein: Q96A56

TP53INP1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53INP1Q96A56 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms