Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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UBE2E3Q969T4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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UBE2E3Q969T4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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UBE2E3Q969T4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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UBE2E3Q969T4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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UBE2E3Q969T4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E3Q969T4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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