Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4DQ92854 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms