Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXN7

RIMKLA, N-acetylaspartylglutamate synthase A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLAQ8IXN7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMKLAQ8IXN7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms