Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms