Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PITRM1Q5JRX3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms