Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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KRTAP21-3Q3LHN1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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KRTAP21-3Q3LHN1 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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KRTAP21-3Q3LHN1 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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