Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms