Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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