Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ITSN1Q15811 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ITSN1Q15811 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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