Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms