Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX1Q15475 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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SIX1Q15475 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SIX1Q15475 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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SIX1Q15475 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SIX1Q15475 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SIX1Q15475 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SIX1Q15475 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SIX1Q15475 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SIX1Q15475 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SIX1Q15475 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SIX1Q15475 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX1Q15475 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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