Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCOLCEQ15113 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms